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C4单细胞ATAC

产品简介

基因表达调控是一个复杂的过程，其中染色质可及性是影响基因表达的直接因素。染色质可及性直接决定了转录因子等反式作用因子能否顺利结合到开放的染色质区域，进而体现转录活跃状态。单细胞ATAC-seq可从单细胞水平上研究染色质开放性，进而寻找与表型相关性强的核心调控因子及调控网络。格致博雅基于DNBelab C-TaiM 4平台推出单细胞ATAC测序服务，该平台具有更高的性价比，更适合大样本量、超大数据单细胞研究。

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产品优势

优势一：高捕获率

细胞捕获效率高达60%以上

优势二：低污染率

双胞污染率，在捕获15,000细胞核时，污染率＜6%

优势三：高性价比单细胞多组学方案

可获得同一细胞类型的RNA和ATAC信息，提供高性价比单细胞多组学方案

优势四：助力高分文章发表

可通过多组学全新视角助力高分文章发表

分析内容

分析内容分析详情可解决问题
1.比对分析

1.1 基因组比对

1.2 细胞计数

1.3 cell-peak矩阵

数据比对
2.Peak分析

2.1 细胞过滤

2.2 降维和聚类

2.3 细胞分群

2.4 差异peak分析

基于染色质开放性信息对细胞进行降维聚类与注释
3.Peak注释

3.1 peak相关基因注释

3.2 peak相关基因GO/KEGG功能富集分析

染色质开放的相关基因注释基功能分析
4.motif分析

4.1 motif富集分析

4.2 motif可视化

转录因子在不同细胞类型中的富集情况
5.个性化分析

5.1 转录因子footprint分析

5.2 染色质共可及性分析

5.3 拟时序分析

5.4 转录因子调控网络分析

5.5 多组学联合分析

与单细胞转录组数据联合分析，构建多组学基因调控网络

送样建议

样本类型组织类型单细胞ATAC推荐送样量
动物送样量新鲜组织＞500mg
冻存组织＞500mg
新鲜血液＞5ml
液体样本＞50ml
细胞样本＞1x106
植物样本送样量植物样本

常规样本＞500mg

花粉、花药＞200mg

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10×Genomics单细胞多组学

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C4单细胞转录组