10×Genomics单细胞多组学


产品简介

基因表达调控是一个复杂的过程,它受到多种因素的综合调控。其中,染色质的开放性作为直接且关键的调控因素之一,扮演着至关重要的角色。染色质可及性直接决定了反式作用因子能否顺利结合到开放的染色质区域,进而体现转录活跃状态。10x Genomics单细胞多组学ATAC+基因表达以数千个细胞为研究对象,同时分析同一细胞中的基因表达和开放染色质。该方法可以构建细胞的基因表达谱及其表观基因组图谱的一体化视图。

产品优势

优势一:项目经验丰富

已完成50+物种的组织抽核,在动植物组织抽核方面具备丰富经验

优势二:更高的精准度

基于同一细胞barcode建立RNA和ATAC对应关系,分析结果更精确

优势三:专业和多样化的分析内容

深入挖掘单细胞ATAC数据,联合单细胞转录组进行机制解析

优势四:高水平期刊发表经验

作为合作单位发表了植物单细胞领域首篇同一细胞核RNA+ATAC检测的多组学研究

分析思路

送样建议

样本类型组织类型单细胞转录组推荐送样量单细胞转录组推荐送样量
动物送样量新鲜组织>500mg>500mg
冻存组织>500mg>500mg
新鲜血液>5ml>5ml
液体样本>50ml>50ml
细胞样本>1x106>1x106
植物样本送样量植物样本

常规样本>500mg

花粉、花药>200mg

常规样本>500mg

花粉、花药>200mg

服务案例

格致博雅作为合作单位发表了植物单细胞领域首篇同一细胞核RNA+ATAC检测的多组学研究

期刊名称:Advanced Science(IF:14.3)

发表时间:2024年4月18日

文章标题:Multiome in the Same Cell Reveals the Impact of Osmotic Stress on Arabidopsis Root Tip Development at Single-Cell Level(单细胞多组方法解析渗透胁迫对拟南芥根尖发育影响)

该研究首先建立了高效、优质的植物细胞核提取方法,之后对正常培养和渗透胁迫下的拟南芥根尖进行细胞核的提取,并在10× Genomics平台上进行单细胞(RNA+ATAC)测序(同一个细胞中同时检测基因表达水平和染色质可及性)。同时检测了16670个拟南芥细胞核的基因表达和染色质可及性,重建了拟南芥根尖细胞类型特异性转录调控网络,揭示了单细胞多组方法在解析渗透胁迫响应机制中的作用。这些发现有助于解析动态分子调控在渗透胁迫响应的时空复杂性,并为干旱和盐胁迫等非生物胁迫的研究提供重要的理论依据,这项研究的技术创新也开拓性地展示出单细胞多组学技术在植物抗逆研究中的广阔应用前景。

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