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中高密度标记检测定制化方案:扩增子测序&液相芯片


方案介绍

扩增子测序:基于多重PCR和二代测序技术,针对目标序列设计带测序接头序列的多重PCR引物,通过PCR扩增富集目的片段,之后通过PCR扩增加上测序引物得到文库后进行二代测序。该技术简化目标样本基因组序列,极大地减少了冗余序列,而且降低了对测序数据量的需求,因而可以更加快速地应用于基因组研究的整体解决方案中。

扩增子测序建库流程图

液相芯片:液相芯片捕获测序技术是通过挑选目标区域多态性高、缺失率低、分布均匀的标记位点信息作为参考设计探针,并合成特异性液相探针,在液相环境下对目标区域序列的定向捕获富集和高通量测序。

 

靶向捕获测序流程图

方案优势

1、可靶向评估上千个(扩增子测序)到上万个(液相芯片)位点,为研究性状相关的基因提供一种经济高效的探索方案。
2、检测特定区域的遗传变异,与全基因组测序等覆盖范围更广泛的方法相比,可减少测序成本和周转时间。
3、根据靶点,灵活设计,深度测序重要基因或感兴趣的区域,实现罕见变异的鉴定。

应用场景

扩增子测序:性状关联分析、功能基因鉴定、品种确权、亲缘关系鉴定、经济性状评估
液相芯片:全基因组关联分析(GWAS)、全基因组连锁分析(QTL定位)、精细定位、群体遗传学分析、全基因组选择、种质资源鉴定、亲缘关系鉴定、经济性状评估

服务流程

扩增子测序服务流程

液相芯片服务流程

服务内容

扩增子测序:

1、体系的开发:针对客户需求和提供的位点信息,设计扩增引物,并进行检测体系的优化及验证。
2、体系的应用:可提供专利申请、试剂盒的生产包装服务,以及基于该体系的大规模样本检测服务。

液相芯片:

1、体系的开发:针对客户需求和提供的位点信息,设计探针,并进行探针的合成及优化。
2、体系的应用:可提供专利申请、试剂盒的生产包装服务,以及基于该体系的大规模样本检测服务。

案例分享

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