RNA甲基化m6A


产品简介

N6甲基腺苷修饰(m6A)是mRNA中常见的甲基化修饰,在mRNA加工过程中发挥重要作用。m6A甲基化测序利用特异识别m6A(N6-甲基腺苷)修饰的抗体,对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀。随后结合高通量测序技术,对沉淀下来的RNA片段进行测序分析。精确鉴定RNA分子中的m6A修饰位置和程度,揭示RNA中m6A修饰的丰度和分布。m6A甲基化测序在生长发育过程中的基因调控、环境适应性、癌症研究、药物开发等领域具有广泛的应用前景。

项目流程

技术优势

低起始量:独家专利技术,将Total RNA起始量由100μg级别降至10μg级别

高重复性:变异系数低,平行性好,可有效实现不同样本间相对定量

分析全面:全面的分析内容,助力高水平研究发表

应用方向

疾病发生发展机制:肿瘤、神经系统疾病、代谢疾病、感染、自身免疫性疾病等

发育和分化:早期胚胎发育、个体/组织/器官生长发育、干细胞分化、衰老等

环境适应性机制:抗逆性、抗病性等

送样建议

样本类型样本量注意事项
组织样本>1g保证样本 新鲜,去掉坏死及有污染的部分,洗净杂
细胞样本>5×107需要E D TA抗凝管 (紫色盖子)收集新鲜的血液
Total RNA>15μg富集后的mRNA应没有其他RNA和DNA污染;样品切忌反复冻融

分析内容

1.数据质量评估1.数据质量评估
2.参考基因组比对2.1 Reads比对结果统计
2.2比对区域分布
2.3比对可视化
3.富集区域(peak)分析3.1 peak鉴定
3.2差异peak分析
3.3 peak注释
4.相关基因分析4.1相关基因注释
4.2相关基因注释富集分析
5.motif分析5.1 motif鉴定
5.2 motif富集分析