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全基因组甲基化WGBS
产品简介
全基因组甲基化测序（WGBS,Whole-genome bisulfite sequencing）是一种被广泛研究的表观遗传修饰方式，结合了亚硫酸氢盐转化方法与新一代高通量测序技术，与组蛋白修饰等方式一起，可在单碱基分辨率水平上检测全基因组DNA甲基化状态，在调控基因表达和染色质构象等方面发挥了重要作用。用重亚硫酸盐（Bisulfite）处理，将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U，通过接头序列介导的PCR技术将U转变为T，与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来，再结合高通量测序技术与参考序列比对，进而判CpG/CHG/CHH 位点是否发生甲基化。
图1 WGBS文库构建流程
实验流程
技术优势
（1）单碱基分辨率：可以精确到单碱基分辨率，精确分析每一个C碱基的甲基化状态；
（2）全基因组覆盖：最大限度地获取完整的全基因组甲基化信息，精确绘制甲基化图谱；
（3）适用范围广：适合所有有参物种，适合各种类型样本；
应用方向
构建全基因组甲基化图谱：WGBS可以最大限度地获取完整的全基因组甲基化信息，绘制精确的单碱基分辨率甲基化图谱，这对于揭示物种基因组甲基化的整体特征具有重要意义。
筛选疾病生物标志物：WGBS可用于研究胚胎发育、衰老等生理活动发展的表观遗传机制，筛选与这些过程相关的甲基化分子标志物。这些标志物在疾病诊断、预后评估以及个性化治疗等方面具有潜在的应用价值。
动植物育种研究：WGBS可用于研究植物或畜禽发育过程中全基因组DNA甲基化的变化，为培育高产、优质、抗逆的动植物新品种提供理论依据。
跨物种甲基化水平比较：通过比较不同物种之间的甲基化模式，可以揭示物种间的表观遗传差异和进化关系。
分析内容
| 1.数据质量评估 | 1.数据质量评估 |
| 2.参考基因组比对 | 2.2比对区域分布 |
| 2.3比对可视化 | |
| 3.单样本甲基化分析 | 3.1染色体甲基化统计 |
| 3.2基因组甲基化环图 | |
| 3.3基因甲基化图谱 | |
| 3.4单样本甲基化统计 | |
| 4.DMRs分析 | 4.1基于基因的DMRs分析 |
| 4.2基于miRNA的DMRs分析 | |
| 4.3重复序列DMRs分析 | |
| 4.4基因的KEGG注释 |
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