10×Genomics单细胞转录组

产品简介

单细胞转录组测序是在单个细胞水平进行高通量转录组测序的一项新技术，能够有效解决细胞异质性以及bulk RNA-seq被掩盖的细胞群内转录组异质性难题，有助于发现新的稀有细胞类型，深入了解细胞生长过程中的表达调控机制。10×Genomics单细胞转录组基于微流控技术生成的油包水液滴系统。在这个系统中，单个细胞与携带唯一DNA条形码的凝胶珠被共同包裹在微小的油滴中，细胞裂解释放出的mRNA随后被逆转录成cDNA，并在这个过程中结合上凝胶珠上的条形码信息。

产品优势

优势一：动植物单细胞样本制备经验丰富

物种经验50+，组织经验180+，项目经验3000+

优势二：业内首家承诺交付质量，建立单细胞服务新标准

单细胞转录组捕获细胞数＞8000，基因中位数＞800

优势三：丰富生信分析和文章发表经验

在Nature communications、Advanced Science等国际高水平期刊发表多篇单细胞署名文章：平均影响因子13.4。其他组学署名文章：累计影响因子200+

分析内容

分析内容	分析详情	可解决问题
1.测序数据统计与评估	1.1 各个样本测序数据基本质控 1.2 各个样本数据比对 1.3 基因表达定量	数据过滤与质控
2.多样本整合分群聚类	2.1 样本聚类分群可视化 2.2 细胞占比统计 2.3 各分群差异基因可视化	样本整合与细胞降维聚类
3.细胞注释	3.1 细胞注释可视化 3.2 细胞占比统计 3.3 细胞注释markers可视化	明确细胞类型，细胞比例在组间的变化，细胞类型特异性高表达基因可视化
4.差异基因分析	4.1 上调表达基因筛选 4.2 上调基因表达分布 4.3 下调表达基因筛选 4.4 下调基因表达分布	基于各个细胞类型的组间差异表达基因鉴定
5.功能富集分析	5.1 GO富集分析 5.2 KEGG富集分析	差异表达基因的功能分析
6.拟时序分析	6.1 Monocle 2 6.2 分支节点分析	推导细胞的分化轨迹，明确关键基因随分化过程的表达模式，明确决定细胞分化命运的关键基因
7.个性化分析	7.1 细胞通讯分析 7.2 转录因子分析 7.3 WGCNA 7.4 Bulk RNA联合分析 7.5 多组学联合分析	基于单细胞分辨率视角挖掘候选基因，构建调控网络

送样建议

样本类型	组织类型	单细胞推荐送样量
动物送样量	新鲜组织	＞500mg
	冻存组织	＞500mg
	新鲜血液	＞5ml
	液体样本	＞50ml
	细胞样本	＞1x10⁶
植物样本送样量	植物样本	常规样本＞500mg 花粉、花药＞200mg

合作案例

格致博雅作为共一和共同通讯合作单位,深度参与了利用单细胞测序技术揭示玉米根系对热胁迫的时空响应研究

发表期刊：Nature Communications（IF：14.7）

发表时间：2024年12月

应用技术：10x Genomics单细胞转录组

文章标题：Single-cell transcriptomes reveal spatiotemporal heat stress response in maize roots

研究结果

本研究对玉米根部组织进行单细胞转录组测序，构建了包含超过35,000个有效细胞的单细胞转录图谱，注释了9种主要细胞类型，鉴定到新的细胞类型特异性标记基因。通过构建细胞分化轨迹和共表达网络分析，鉴定了响应热胁迫的调控模块和关键同源基因。此外，该研究证实了皮层细胞类型特异性基因在调节玉米主根顶端皮层的功能和耐热性密切相关，为评估热胁迫耐受性和作物改良提供了新的视角和依据。

C4单细胞转录组

无

让生命可知

客服热线：010-53918309

E-Mail: support@glbizzia.com

北京市大兴区生物医药产业基地联东U谷17号楼
天津市武清开发区福源道北侧创业总部基地B15号楼609室
浙江省桐乡市经济开发区悦明路89号视觉物联创新中心1期3幢4层

手机端官网

公众号

网站建设：中企动力北京 SEO标签

营业执照