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T2T基因组
产品介绍
T2T(Telomere-to-telomere) 基因组是指基因组准确性高、连续性高、完整性高的端粒到端粒的高质量基因组。 T2T基因组完成图是基因组组装的终极目标。T2T基因组的组装，有助于对基因组中高重复序列区域或高重复结构进行深入研究，帮助解析着丝粒和端粒等复杂结构的变异特征和进化模式。
组装策略
| 测序/组装 | <1G物种 | 2~3G哺乳动物 |
| Illumina | 50× | 100× |
| ONT Ultra-long（N50>100k) | 80× | 50~100× |
| PacBio HiFi | 30× | 50× |
| Hi-C | 100× | 100× |
应用场景
- 基因组版本的更新：T2T基因组的精确性和完整性使我们能够看到整个基因组的完整画卷。
- 新基因的鉴定：更完整的基因组可以帮助我们发现更多之前未被注释到的新基因，并研究这些新基因在特定物种中发挥的功能。
- 着丝粒区域研究：对着丝粒区域进行ChIP-seq及FISH等验证，挖掘（近）着丝粒区域遗传信息（结构、功能）、甲基化等相关研究。
组装案例
| 物种类别 | 基因组大小 | 杂合度 | 重复率 | 组装大小 | Conting N50 | BUSCO值 |
| 某动物 | ~0.9 Gb | 0.93 % | 47.4 % | 902 Mb | 28 Mb | 99.5% |
| 某动物 | ~3.0 Gb | 0.27% | 20.2% | 2,950 Mb | 150 Mb | 99.2% |
| 某动物 | ~0.5 Gb | 0.75% | 33.8% | 480 Mb | 51 Mb | 98.7% |
| 某植物 | ~1.9 Gb | 0.65 % | 25.6 % | 1,912 Mb | 47 Mb | 98.7% |
| 某植物单倍型 | ~1.0 Gb | 1.53 % | 57.6 % | 976Mb | 15 Mb | 96.8% |
| 967 Mb | 8 Mb | 97.1% |
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