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全基因组de novo
产品简介
从头测序，即de novo测序，是一种无需依赖任何已知参考序列即可对特定物种进行基因组测序的方法。通过生物信息学分析实现将这些测序数据进行精确的拼接与组装，进而获取该物种的完整基因组序列图谱。利用全基因组从头测序技术，我们不仅可以解析动植物的全基因组序列，还能推动该物种相关的一系列后续研究，显著加速其科学研究进程。全基因组序列图谱构建完成后，可进一步搭建该物种的基因组数据库，为开展高效的后基因组学研究提供一个高效的平台，将极大地促进后续的基因挖掘工作。
产品流程
产品优势
平台全面：同时具备三代测序平台PacBio 与 Nanopore，可以实现对动植物基因组进行长读长、高精度的测序。
服务满意：专属化定制方案，定期反馈项目进展，与分析人员零距离沟通。
分析专业：具有丰富的基因组组装经验，助力合作客户发表多篇文章，署名研究成果荣获2024中国农业科学十大进展
应用领域
获得物种参考序列
研究物种起源与演化历史
挖掘功能基因
搭建物种数据库
样本要求
| 测序平台 | 文库类型 | 样品类型 | 样品浓度 | 样本量 |
| Nanopore | 20 Kb | 基因组DNA | 20 ng/μl | 10 μg |
| PacBio | 20 Kb | 20 ng/μl | 10 μg | |
| DNBSEQ | 350 Kb | 20 ng/μl | 1.5 μg | |
| Hi-C | -- | 完成甲醛交联的DNA/新鲜血液/活体组织 | -- | -- |
测序策略
| 测序平台 | 文库大小 | 测序读长 | 推荐测序深度 | 主要用途 |
| Nanopore | 20 Kb及以上 | 10 Kb及以上 | 100X/30X | 组装 |
| PacBio | 20 Kb及以上 | 10 Kb及以上 | 120X | 组装 |
| DNBSEQ | 350 bp | PE150 | 50-100X | Survey/纠错 |
| Hi-C | 250-450 bp | PE100 / PE150 | 50-100X | Hi-C辅助组装定位 |
注：表中提及的组装手段可根据物种特性及技术特点进行选择。
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