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猪低深度全基因组重测序
产品介绍
低深度全基因组重测序（Low coverage whole genome sequencing，LcWGS）是一种低成本的基因分型技术，通过对群体中所有个体进行1X重测序，基于大样本量高深度reference panel对缺失基因型进行填充，得到全基因组范围内的高密度SNP，极好地控制测序成本。
借助格致博雅构建的猪高质量reference panel，能以较低的成本获取猪全基因组水平高准确度的遗传标记，对性状相关候选基因和功能突变进行广泛筛选，提高基因组育种值估计（GEBV）的预测准确性，为猪的早期选择及遗传改良提供强有力的数据支持。
产品优势
1、经过上百个样本的建库测试，提供稳定的1X测序覆盖度，可达58%以上；
2、构建牛的高质量基因型填充参考面板，基因填充一致性可达0.98以上；
3、一键化基因型填充流程，精确高效获取覆盖全基因组的SNP。
项目流程
周期：10天
送样建议
样本类型 | 送样量 |
DNA样本 | ≧20ng/μl；OD260/OD280：1.8-2.0；总量不低于100ng; |
血液 | 全血≥400μl |
毛发 | ＞30根（带毛囊） |
组织 | ≥500mg |
应用案例
该研究基于猪平均测序深度为0.73X的LcWGS数据，基因型填充后对猪21个重要性状进行了GWAS分析，识别了与7个性状相关的14个QTLs。
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